“先皇初服红丸时，内阁首辅方从哲草拟圣旨赏给献红丸的李可灼白银五十两。方从哲和李可灼两人都有大罪。从医之人，不是三代医家传承，有病的人不能吃他的药，先帝的脉搏雄壮有力而浮动甚大，这表明三焦火动，宜用清火之药而不能用而不能用助火之药，这是很明显的。红铅乃是妇女的经水，是纯火之中的精华，将其投入虚火燥热的病人，不是害死他吗！在朝廷内外人心不稳之时，却敢使用没有验方没有制药方法的药冒充金丹，轻则应当对李可灼处以庸医杀人之罪，却蒙皇上颁发奖赏，这不过是借此以阻塞外廷的议论。”
御史王安舜批评了方从哲和李可灼，御史郑宗周则是向给朱常洛吃大黄的崔文升发炮。他讲：
“过去的梃击案的张差事件，在宫门持木棍，几乎酿成意外。只因为神宗皇帝优容大度，没能完全处罚他们，所以崔文升敢于效仿他们。请将崔文升敢于效仿他们。请将崔文升砍成寸断用以在祖庙面前谢罪。”
听完这两个大臣讲话后，御史郭如楚、冯三元、给事中魏应嘉、太常寺卿曹珖、光禄寺少卿高攀龙、主事吕维琪等先后附议要求惩治崔文升和李可灼。
红丸案之后，方从哲拟写御旨，将崔文升和李可灼交给司礼监处理。现在他们二人关在诏狱里头，朱由校最近事务繁忙，把他们俩忘了。
泰昌皇帝朱常洛虽然是因为过度娱乐和错误用药而死的，可是他并不想背上这个丢人死法的坏名声。所以朱常洛临终前一直推说自己身体不好。在朱由校心里，这个便宜老爹对他还是不错的。所以他就要想一个好借口既处理了庸医，又能尽量保存朱常洛的颜面。正在朱由校思考如何处理他们的时候，又有大臣发言了。
给事中惠世扬讲话开门见山直接弹劾方从哲有十条大罪、三条理由可杀。他进言：
“方从哲一个人为相七年，妨碍贤才害了国家，是第一条罪。
骄傲无礼，延误了对皇帝的悼念，是第二条罪。
在慈庆宫里发生梃击案件，却庇护奸党，是第三条罪。
根据自己心里想的肆意妄为，破坏了皇帝的法令，是第四条罪。
放纵儿子杀人，蔑视国家法令