在给皇帝的上疏最后，徐兆魁建议彻底查封东林书院。
写完上疏以后，徐兆魁风风火火地指挥属下在应天府清丈田亩。也难为他一个七旬的老人了，还要到现场出查看官吏们有没有尽心尽责。有一天，徐兆魁坐轿子回巡抚衙门，猛听轿前一个女人嘶声凄厉哭喊道：
“冤枉啊……青天大老爷！”
惨厉的哭叫声带着颤声和呜咽，激得昏昏欲睡的徐兆魁浑身一个激凌，接着便听前头衙役们怒喝：“不许拦轿！那边就是应天府衙门，到应天府去！”
那女人似乎不肯离开，在衙役的怒喝拉扯中号啕大哭：“天杀的！你们当官的就这么凶！如今的应天府没有海青天啊……”
“住轿。”徐兆魁自视为断案如神，听见这妇人的话，心里很是震动。他用脚顿一顿轿底，轿夫就把大轿落了下来。
徐兆魁哈腰出轿，果见一个三十岁上下的女人蓬头垢面，浑身泥水跪在轿前，见大官出来，爬跪几步连连磕头，哭叫道：“大老爷为我做主……我男人叫人冤杀在松江府华